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根据英国杂志《自然》21日发表的一篇论文,法国卡斯塔内托洛桑国家农业研究所的研究人员已经测序并获得了一个高质量的向日葵参考基因组,这在以前是很难完成的。该资源将为今后的研究提供帮助,并帮助人们在考虑农业限制和人类营养需求的前提下,利用遗传多样性提高向日葵的抗逆性和出油率。
向日葵是一种全球性的油料作物。由于它在包括干旱在内的各种环境条件下保持稳定产量的能力,这一物种可以说显示出适应气候变化的希望。然而,直到现在,研究人员一直难以完成向日葵基因组的组装,因为它主要由高度相似的相关序列组成。加拿大、美国和法国的政府部门和机构都资助了他们的研究团队来测量和分析向日葵基因组。
这一次,尼古拉斯·兰格拉德和他来自法国洛桑国家农业研究所的同事们对向日葵基因组进行了测序,并进行了比较和全基因组分析,给菊花这种开花植物的进化史带来了新的启示。同时,向日葵基因组将成为菊科植物的模式基因组。菊科是目前世界上最大的植物科,共有24,000种,包括许多作物、药用植物、园艺作物和有害杂草。向日葵基因组序列可以为理解整个“家族”提供一个非常有用的模板。
在这项研究中,小组成员还发现了新的候选基因,重建了开花期和脂类代谢的遗传网络,并发现开花期的遗传网络是由最近的全基因组加倍形成的。
这项研究意味着数千万年来,古老的水平同源基因(基因组中通过增殖产生的同源基因)可以保存在同一个调控网络中。最后,作者得出结论,他们的研究加强了向日葵作为生物学、进化和气候变化适应研究模型的地位,并有助于加速向日葵育种。
总编辑圈
无论是植物、动物还是微生物,物种的延续都是从生命一开始就写下的重要“指令”。为了知道生命是如何执行这一指令的,首先必须弄清楚生命硬盘中的绝密文件(基因组)。从这个意义上说,人类扮演着“生活黑客”的角色。我们不仅应该了解自己的基因组,还应该了解其他物种的基因组,从而为人类的福祉做出贡献。这正是科学家费了一番周折才最终完成的向日葵基因组测序所发生的事情。
职责:胡彦明
标题:高质量向日葵基因组“来了”
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